Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce3Q9CPR8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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