Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdca3Q99M54 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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