Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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