Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms