Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms