Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Uhrf1Q8VDF2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1Q8VDF2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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