Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcaQ8VC88 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GcaQ8VC88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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