Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hecw1Q8K4P8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms