Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms