Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q8C5C9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms