Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmod1Q8BVA4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmod1Q8BVA4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms