Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms