Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc29Q80VM3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms