Protein–RNA interactions for Protein: Q80UP5

Ankrd13a, Ankyrin repeat domain-containing protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13aQ80UP5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd13aQ80UP5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms