Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vtcn1Q7TSP5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vtcn1Q7TSP5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms