Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh8Q7TSK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms