Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms