Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap2lQ7TS74 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms