Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms