Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms