Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msl2Q69ZF8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms