Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms