Protein–RNA interactions for Protein: Q5IRJ6

Slc30a9, Zinc transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a9Q5IRJ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc30a9Q5IRJ6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms