Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Fam220aQ3ZN08 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam220aQ3ZN08 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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