Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ckap2Q3V1H1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap2Q3V1H1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms