Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk4Q3V129 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms