Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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