Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp48Q3V0C5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp48Q3V0C5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp48Q3V0C5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp48Q3V0C5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp48Q3V0C5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Usp48Q3V0C5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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Usp48Q3V0C5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Usp48Q3V0C5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp48Q3V0C5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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