Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zmat1Q3V0C1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zmat1Q3V0C1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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