Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms