Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms