Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf44Q3UHJ8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms