Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms