Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U595 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U595 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Q3U595 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Q3U595 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Q3U595 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U595 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U595 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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