Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TQQ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TQQ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms