Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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