Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms