Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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