Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnnm1Q0GA42 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnnm1Q0GA42 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms