Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc7a1Q09143 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms