Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms