Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrx2Q06348 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms