Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CkbQ04447 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CkbQ04447 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms