Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja5Q01231 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms