Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms