Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb1Q00420 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms