Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cds1P98191 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms