Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx2P81066 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms