Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps11P62281 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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