Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms